尔喀五部中的扎鲁特部，因屡次劫杀后金派往漠南蒙古科尔沁部的使臣为由，发动第三次讨伐漠南蒙古内喀尔喀之战。

这次漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗：孛儿只斤·林丹汗巴图尔（虎墩兔）再度趁火打劫，攻击漠南蒙古内喀尔喀残部，服从者皆养之，拒敌者被杀。

一时间漠南蒙古内喀尔喀五部在后金和漠南蒙古察哈尔部的夹击下土崩瓦解，只剩下了漠南蒙古内喀尔喀巴林部和扎鲁特部。

10月21日，在李氏朝鲜王国昌城都护府附近驻扎的明义州府右参将：徐孤臣，向李氏朝鲜郡王转告了辽东都指挥使司方面东虏建奴鞑子新即位的大汗，有可能会攻打李氏朝鲜王国，以及定辽右卫附近集结大量后金军的消息。

为了防备后金和拱卫京畿右道王京汉城府，李氏朝鲜郡王陆续设置了；扈卫厅、御营厅、总戎厅，等新军营，与先王李氏朝鲜宣祖河城大君昭敬郡王：李昖，时建立的「训练都监」构成中央防备体制，共计约有2万5千人，并预备在后金入侵时，自己打算逃到江华都护府避难。

11月初9日，又由咸镜南道调兵2千人至平安东西道戍守，与平安东西道原有军队一起防备后金。

同时在明东江总兵兼征虏前将军：毛文龙，的关系上，李氏朝鲜郡王虽然刚开始表现出积极合作的姿态（主要是为了便于获得大明帝国的册封），但是毛总兵也不是省油的灯，他借着大明撑腰，毅然在李氏朝鲜王国要钱要粮，不给就抢，所以李氏朝鲜王国军民也不怎么欢迎毛家军。

12月11日，从陕西承宣布政使司汉中府进入四川承宣布政使司保宁府的流寇，又从眉林沟进攻，被明七盘关守备：王虎，所击败还斩杀流寇首领：纪守恩，导致流寇残部退回陕西承宣布政使司汉中府宁羌州地界。

明天启七年公元1627年正月初3日，漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗又来继续趁火打劫，还袭击了漠南蒙古内喀尔喀扎鲁特部和巴林残部，结果是这两个部落少部分族人被漠南蒙古察哈尔部兼并，大部分族人则投奔到漠南蒙古科尔沁部。

后来不堪漠南蒙古科尔沁部的侵袭，又归附到后金汗国麾下被整编为札萨克旗。

曾经威名赫赫的漠南蒙古内喀尔喀五部至此彻底土崩瓦解，消失在了历史长河中，其中漠南蒙古内喀尔喀巴林部和扎鲁特部，好歹还各自设有有左右札萨克旗，但是漠南蒙古内喀尔喀乌济叶特部和巴岳特部却消失的最彻底，最后连部地名都没有留下。

至于漠南蒙古内喀尔喀翁吉剌特部虽然没有被整编为札萨克旗，但还有大部分族人依附于漠南蒙古内喀尔喀扎鲁特部。

由于漠南蒙古内喀尔喀翁吉喇特部首领：孛儿只斤·巴哈达尔汉（暖兔）第四子：孛儿只斤·喇巴泰，和兄长：孛儿只斤·莽胡尔台，相互争夺属民，就率领十个苏木的部众脱离漠南蒙古内喀尔喀扎鲁特部札萨克旗，前来投奔漠南蒙古内喀尔喀巴林部札萨克旗的淑慧公主。

不过后来又有两个苏木的属民，不堪忍受漠南蒙古内喀尔喀巴林部札萨克旗人的沉重赋税，而逃到漠南蒙古翁牛特部左旗，由此漠南蒙古内喀尔喀巴林部札萨克旗就从弘吉剌十苏木就变成了八苏木。

在漠南蒙古科尔沁部已投入后金阵营，以及漠南蒙古内喀尔喀五部覆灭的情况下，后金天聪汗开始向漠南蒙古察哈尔部进行渗透。

而漠南蒙古察哈尔部的八个鄂托克中，漠南蒙古奈曼部和敖汉部就夹在，漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗与后金天聪汗，这两股势力之间，他们为缓解两者间的对立关系，甘愿充当调停者的角色。

正月初5日，朝廷又加封明都察院右佥都御史：袁崇焕，为「兵部右侍郎」其子孙世荫北镇抚司锦衣卫千户。

可明兵部右侍郎：